慢性房颤患者有较高的血栓发生率。过去有血栓病史、严重瓣膜病、高血压、糖尿病、老年患者、左心房扩大、冠心病等均属发生血栓的危险因素。存在以上任何一种情况，均应接受长期的抗凝治疗。口服华法林，使凝血酶原时间国际正常化比值（INR）维持在2.0~3.0之间，能安全有效的预防脑卒中的发生。

        不适宜应用华法林治疗的患者、以及无以上危险因素的患者，可改用阿司匹林日（300 mg）治疗。施行长期的抗凝治疗应考虑个体的不同情况，严密检测药物可能有潜在的出血危险。房颤持续不超过2天，复律前无须作抗凝治疗。否则应在复律前3周接受华法林治疗，待心律转复后继续治疗3~4周。紧急 复律治疗可用静注肝素抗凝。

        房蝉发作频繁、心室率很快、药物治疗无效者，可施行房室结改良或消融术，并同时安置频率应答式心室按需起搏或双腔起搏器。其他治疗方法包括外科手术、植入式心房除颤器等。房颤时心室率较慢，患者耐受良好者，除预防栓塞并发症外，通常无虚特殊治疗。